Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
APOBEC3HQ6NTF7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOBEC3HQ6NTF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms