Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD20A3Q5VUR7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD20A3Q5VUR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms