Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF38BQ5VTL8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF38BQ5VTL8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF38BQ5VTL8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms