Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC01545Q5VT33 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC01545Q5VT33 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms