Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL8

PRAMEF19, PRAME family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF19Q5SWL8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRAMEF19Q5SWL8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRAMEF19Q5SWL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRAMEF19Q5SWL8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF19Q5SWL8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms