Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF4Q2M2E3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODF4Q2M2E3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms