Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNXAQ16473 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TNXAQ16473 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNXAQ16473 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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