Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 KIF13B-204ENST00000523130 1267 ntTSL 519.17■□□□□ 0.663e-12■■■■■ 53.3
PCBP2Q15366 SRRM2-213ENST00000573311 732 ntTSL 214□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 53.3
PCBP2Q15366 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 210.33□□□□□ -0.763e-8■■■■■ 53.3
PCBP2Q15366 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.725e-26■■■■■ 53.2
PCBP2Q15366 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.795e-26■■■■■ 53.2
PCBP2Q15366 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.845e-26■■■■■ 53.2
PCBP2Q15366 CLTCL1-207ENST00000611723 838 ntTSL 215.51■□□□□ 0.077e-13■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.187e-13■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.377e-13■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 CLTCL1-209ENST00000617103 4859 ntTSL 1 (best)10.27□□□□□ -0.767e-13■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.867e-13■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 CLTCL1-211ENST00000621271 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.897e-13■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 CLTCL1-208ENST00000615606 4994 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.967e-13■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 EP400-206ENST00000611118 2403 ntTSL 212.24□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-205ENST00000638779 1983 ntTSL 521.84■■□□□ 1.091e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-204ENST00000639040 2568 ntTSL 517.98■□□□□ 0.471e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-201ENST00000638968 3175 ntTSL 515.64■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-208ENST00000640357 3488 ntTSL 512.58□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-206ENST00000639171 5352 ntTSL 511.09□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 AC118553.2-207ENST00000640238 2901 ntTSL 56.28□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 53.1
PCBP2Q15366 LAMA5-209ENST00000481120 386 ntTSL 221.42■■□□□ 1.022e-15■■■■■ 53
PCBP2Q15366 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 59.84□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 53
PCBP2Q15366 CFI-203ENST00000504853 2368 ntTSL 26.21□□□□□ -1.421e-10■■■■■ 53
PCBP2Q15366 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 52.9
PCBP2Q15366 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 52.9
PCBP2Q15366 MKL1-207ENST00000463769 531 ntTSL 1 (best)16.42■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 52.9
PCBP2Q15366 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 52.9
PCBP2Q15366 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 52.9
PCBP2Q15366 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 52.9
PCBP2Q15366 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 52.8
PCBP2Q15366 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.213e-12■■■■■ 52.8
PCBP2Q15366 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.213e-12■■■■■ 52.8
PCBP2Q15366 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.753e-12■■■■■ 52.8
PCBP2Q15366 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 52.8
PCBP2Q15366 C3-213ENST00000600744 708 ntTSL 513.36□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 52.7
PCBP2Q15366 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 52.7
PCBP2Q15366 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 52.7
PCBP2Q15366 MGA-210ENST00000568630 584 ntTSL 314.03□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 52.6
PCBP2Q15366 MGA-204ENST00000563576 3537 ntTSL 510.79□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 52.6
PCBP2Q15366 MALRD1-202ENST00000377266 4461 ntTSL 510.41□□□□□ -0.744e-9■■■■■ 52.6
PCBP2Q15366 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.744e-9■■■■■ 52.6
PCBP2Q15366 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 316.87■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 52.6
PCBP2Q15366 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 CLASRP-202ENST00000391952 2213 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 CLASRP-213ENST00000591410 572 ntTSL 410.35□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 EXT1-203ENST00000437196 1446 ntTSL 513.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 EXT1-202ENST00000436216 700 ntTSL 311.67□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 52.5
PCBP2Q15366 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 LPP-219ENST00000494233 412 ntTSL 55.71□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.569e-14■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.479e-14■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.899e-14■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.219e-14■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 GSR-203ENST00000523295 913 ntTSL 312.65□□□□□ -0.389e-14■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 GSR-202ENST00000521479 582 ntTSL 39.17□□□□□ -0.949e-14■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 PCNX1-206ENST00000554292 402 ntTSL 427■■□□□ 1.913e-7■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 PCNX1-209ENST00000554879 4431 ntTSL 1 (best)15.99■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 PTPRK-215ENST00000498284 524 ntTSL 55.95□□□□□ -1.465e-10■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 PTPRK-202ENST00000368205 662 ntTSL 25.07□□□□□ -1.65e-10■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 PTPRK-213ENST00000490332 612 ntTSL 54.96□□□□□ -1.625e-10■■■■■ 52.4
PCBP2Q15366 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.727e-8■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.515e-25■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 FBXO41-202ENST00000519873 580 ntTSL 417.3■□□□□ 0.365e-25■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-25■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-208ENST00000470335 824 ntTSL 219.63■□□□□ 0.732e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.372e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-207ENST00000458248 742 ntTSL 314.8□□□□□ -0.042e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-203ENST00000431430 572 ntTSL 414.7□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-205ENST00000444967 1045 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-212ENST00000494929 550 ntTSL 414.45□□□□□ -0.12e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-204ENST00000443285 792 ntTSL 414.07□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-211ENST00000490556 708 ntTSL 313.55□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-209ENST00000479601 1389 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 KLHL22-206ENST00000451553 724 ntTSL 310.76□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 NFS1-208ENST00000440385 1794 ntTSL 512.05□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 NFS1-205ENST00000413203 646 ntTSL 511.55□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.75e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.455e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 WFIKKN1-202ENST00000573440 4878 nt15.65■□□□□ 0.15e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 RAB11B-AS1-203ENST00000597785 515 ntTSL 312.66□□□□□ -0.385e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 ENAH-207ENST00000497899 807 ntTSL 1 (best)9.15□□□□□ -0.945e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 ENAH-205ENST00000391874 888 ntTSL 37.14□□□□□ -1.275e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.575e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 RAB3GAP1-204ENST00000487003 3506 ntTSL 55.16□□□□□ -1.585e-15■■■■■ 52.1
PCBP2Q15366 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 52
PCBP2Q15366 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 52
PCBP2Q15366 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 58.15□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 52
PCBP2Q15366 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 27.85□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 52
PCBP2Q15366 RNF13-205ENST00000466478 593 ntTSL 514.81□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 52
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 311.7 ms