RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440385.5

NFS1-208, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 5

Gene NFS1, Length 1,794 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-208ENST00000440385 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.96■■■□□ 2.55
NFS1-208ENST00000440385 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.59■■■□□ 2.01
NFS1-208ENST00000440385 ABCC9O60706 1549 aa27.1■■□□□ 1.93
NFS1-208ENST00000440385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.07■■□□□ 1.76
NFS1-208ENST00000440385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.05■■□□□ 1.76
NFS1-208ENST00000440385 NACADO15069 1562 aa26.01■■□□□ 1.75
NFS1-208ENST00000440385 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.81■■□□□ 1.72
NFS1-208ENST00000440385 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
NFS1-208ENST00000440385 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.63■■□□□ 1.69
NFS1-208ENST00000440385 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.33■■□□□ 1.65
NFS1-208ENST00000440385 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
NFS1-208ENST00000440385 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.15■■□□□ 1.62
NFS1-208ENST00000440385 SCRIBQ14160 1630 aa25.13■■□□□ 1.61
NFS1-208ENST00000440385 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
NFS1-208ENST00000440385 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.91■■□□□ 1.58
NFS1-208ENST00000440385 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
NFS1-208ENST00000440385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.49■■□□□ 1.51
NFS1-208ENST00000440385 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.4■■□□□ 1.5
NFS1-208ENST00000440385 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
NFS1-208ENST00000440385 SMARCA4P51532 1647 aa24.03■■□□□ 1.44
NFS1-208ENST00000440385 NCAPD3P42695 1498 aa23.98■■□□□ 1.43
NFS1-208ENST00000440385 SMARCA2P51531 1590 aa23.97■■□□□ 1.43
NFS1-208ENST00000440385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.95■■□□□ 1.42
NFS1-208ENST00000440385 HMGXB3Q12766 1538 aa23.84■■□□□ 1.41
NFS1-208ENST00000440385 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.81■■□□□ 1.4
NFS1-208ENST00000440385 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.8■■□□□ 1.4
NFS1-208ENST00000440385 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
NFS1-208ENST00000440385 WIZO95785 1651 aa23.54■■□□□ 1.36
NFS1-208ENST00000440385 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NFS1-208ENST00000440385 ERCC6Q03468 1493 aa23.46■■□□□ 1.35
NFS1-208ENST00000440385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.39■■□□□ 1.33
NFS1-208ENST00000440385 NESP48681 1621 aa23.36■■□□□ 1.33
NFS1-208ENST00000440385 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NFS1-208ENST00000440385 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.3■■□□□ 1.32
NFS1-208ENST00000440385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.3■■□□□ 1.32
NFS1-208ENST00000440385 CUX2O14529 1486 aa23.23■■□□□ 1.31
NFS1-208ENST00000440385 CFTRP13569 1480 aa23.1■■□□□ 1.29
NFS1-208ENST00000440385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.09■■□□□ 1.29
NFS1-208ENST00000440385 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.06■■□□□ 1.28
NFS1-208ENST00000440385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NFS1-208ENST00000440385 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.02■■□□□ 1.28
NFS1-208ENST00000440385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.01■■□□□ 1.27
NFS1-208ENST00000440385 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.99■■□□□ 1.27
NFS1-208ENST00000440385 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NFS1-208ENST00000440385 PRDM2Q13029 1718 aa22.89■■□□□ 1.25
NFS1-208ENST00000440385 WDR62O43379 1518 aa22.88■■□□□ 1.25
NFS1-208ENST00000440385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NFS1-208ENST00000440385 ABCC8Q09428 1581 aa22.71■■□□□ 1.23
NFS1-208ENST00000440385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.66■■□□□ 1.22
NFS1-208ENST00000440385 TOPBP1Q92547 1522 aa22.6■■□□□ 1.21
NFS1-208ENST00000440385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.59■■□□□ 1.21
NFS1-208ENST00000440385 IFT140Q96RY7 1462 aa22.55■■□□□ 1.2
NFS1-208ENST00000440385 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
NFS1-208ENST00000440385 SOGA1O94964 1423 aa22.37■■□□□ 1.17
NFS1-208ENST00000440385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NFS1-208ENST00000440385 CUX1P39880 1505 aa22.35■■□□□ 1.17
NFS1-208ENST00000440385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.33■■□□□ 1.17
NFS1-208ENST00000440385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NFS1-208ENST00000440385 OSCARQ8IYS5 282 aa22.31■■□□□ 1.16
NFS1-208ENST00000440385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.28■■□□□ 1.16
NFS1-208ENST00000440385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NFS1-208ENST00000440385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.154e-6■■■□□ 17.2
NFS1-208ENST00000440385 WDR97A6NE52 1622 aa22.25■■□□□ 1.15
NFS1-208ENST00000440385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
NFS1-208ENST00000440385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NFS1-208ENST00000440385 TOP2BQ02880 1626 aa22.17■■□□□ 1.14
NFS1-208ENST00000440385 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.14■■□□□ 1.14
NFS1-208ENST00000440385 FBLN2P98095 1184 aa22.14■■□□□ 1.13
NFS1-208ENST00000440385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.13■■□□□ 1.13
NFS1-208ENST00000440385 GRIN2BQ13224 1484 aa22.12■■□□□ 1.13
NFS1-208ENST00000440385 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.1■■□□□ 1.13
NFS1-208ENST00000440385 SYNJ1O43426 1573 aa22.1■■□□□ 1.13
NFS1-208ENST00000440385 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NFS1-208ENST00000440385 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NFS1-208ENST00000440385 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.06■■□□□ 1.12
NFS1-208ENST00000440385 CHD1O14646 1710 aa22.01■■□□□ 1.11
NFS1-208ENST00000440385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22■■□□□ 1.11
NFS1-208ENST00000440385 PBRM1Q86U86 1689 aa21.99■■□□□ 1.11
NFS1-208ENST00000440385 SYNJ2O15056 1496 aa21.98■■□□□ 1.11
NFS1-208ENST00000440385 TRIM41Q8WV44 630 aa21.89■■□□□ 1.09
NFS1-208ENST00000440385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.88■■□□□ 1.09
NFS1-208ENST00000440385 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.85■■□□□ 1.09
NFS1-208ENST00000440385 KIF27Q86VH2 1401 aa21.83■■□□□ 1.09
NFS1-208ENST00000440385 ARHGEF11O15085 1522 aa21.83■■□□□ 1.09
NFS1-208ENST00000440385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.83■■□□□ 1.08
NFS1-208ENST00000440385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.83■■□□□ 1.08
NFS1-208ENST00000440385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.83■■□□□ 1.08
NFS1-208ENST00000440385 ADAMTS12P58397 1594 aa21.81■■□□□ 1.08
NFS1-208ENST00000440385 GRIN2AQ12879 1464 aa21.8■■□□□ 1.08
NFS1-208ENST00000440385 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.78■■□□□ 1.08
NFS1-208ENST00000440385 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.71■■□□□ 1.07
NFS1-208ENST00000440385 IGF1RP08069 1367 aa21.69■■□□□ 1.06
NFS1-208ENST00000440385 NUP160Q12769 1436 aa21.69■■□□□ 1.06
NFS1-208ENST00000440385 CUL7Q14999 1698 aa21.66■■□□□ 1.06
NFS1-208ENST00000440385 CEP170Q5SW79 1584 aa21.64■■□□□ 1.05
NFS1-208ENST00000440385 ARAP1Q96P48 1450 aa21.61■■□□□ 1.05
NFS1-208ENST00000440385 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.61■■□□□ 1.05
NFS1-208ENST00000440385 JPH4Q96JJ6 628 aa21.55■■□□□ 1.04
NFS1-208ENST00000440385 SHROOM2Q13796 1616 aa21.51■■□□□ 1.03
NFS1-208ENST00000440385 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.5■■□□□ 1.03
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