Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KRT31Q15323 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KRT31Q15323 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT31Q15323 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms