Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RABEP1Q15276 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABEP1Q15276 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
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