Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SQLEQ14534 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SQLEQ14534 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SQLEQ14534 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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