Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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NID2Q14112 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NID2Q14112 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NID2Q14112 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NID2Q14112 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NID2Q14112 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NID2Q14112 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NID2Q14112 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NID2Q14112 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NID2Q14112 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NID2Q14112 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NID2Q14112 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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NID2Q14112 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NID2Q14112 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NID2Q14112 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NID2Q14112 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
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NID2Q14112 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NID2Q14112 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NID2Q14112 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NID2Q14112 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NID2Q14112 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NID2Q14112 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NID2Q14112 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NID2Q14112 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NID2Q14112 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NID2Q14112 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NID2Q14112 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NID2Q14112 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NID2Q14112 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NID2Q14112 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NID2Q14112 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NID2Q14112 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NID2Q14112 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NID2Q14112 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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NID2Q14112 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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NID2Q14112 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NID2Q14112 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NID2Q14112 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NID2Q14112 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NID2Q14112 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NID2Q14112 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NID2Q14112 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NID2Q14112 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NID2Q14112 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NID2Q14112 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NID2Q14112 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NID2Q14112 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NID2Q14112 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NID2Q14112 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NID2Q14112 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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