Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE6HQ13956 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE6HQ13956 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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