Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPB3Q12988 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPB3Q12988 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPB3Q12988 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms