Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F3Q08477 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYP4F3Q08477 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms