Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF9Q07011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF9Q07011 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF9Q07011 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms