Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABPB1Q06547 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GABPB1Q06547 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABPB1Q06547 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms