Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNEQ04844 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNEQ04844 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNEQ04844 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms