Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL6Q02878 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL6Q02878 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL6Q02878 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms