Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRF8Q02556 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRF8Q02556 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRF8Q02556 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235 ms