Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
APBA1Q02410 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
APBA1Q02410 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
APBA1Q02410 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms