Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP11AP98196 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP11AP98196 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP11AP98196 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP11AP98196 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP11AP98196 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP11AP98196 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 397.4 ms