Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HERVK_113P62684 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HERVK_113P62684 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HERVK_113P62684 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms