Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCCD1P59942 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCCD1P59942 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCCD1P59942 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms