Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB15P59190 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB15P59190 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB15P59190 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB15P59190 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB15P59190 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB15P59190 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB15P59190 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB15P59190 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB15P59190 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB15P59190 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB15P59190 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB15P59190 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB15P59190 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB15P59190 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB15P59190 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB15P59190 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB15P59190 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB15P59190 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB15P59190 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB15P59190 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB15P59190 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB15P59190 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB15P59190 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB15P59190 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB15P59190 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB15P59190 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB15P59190 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB15P59190 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB15P59190 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB15P59190 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB15P59190 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms