Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRADP55042 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRADP55042 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRADP55042 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRADP55042 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRADP55042 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRADP55042 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRADP55042 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRADP55042 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRADP55042 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRADP55042 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RRADP55042 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRADP55042 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RRADP55042 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRADP55042 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRADP55042 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRADP55042 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRADP55042 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRADP55042 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RRADP55042 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRADP55042 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRADP55042 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRADP55042 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRADP55042 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRADP55042 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRADP55042 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRADP55042 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RRADP55042 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRADP55042 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRADP55042 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRADP55042 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRADP55042 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRADP55042 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRADP55042 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRADP55042 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRADP55042 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRADP55042 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRADP55042 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRADP55042 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRADP55042 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRADP55042 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRADP55042 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms