Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD4P55036 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD4P55036 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSMD4P55036 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSMD4P55036 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms