Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA4P52798 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EFNA4P52798 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA4P52798 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms