Protein–RNA interactions for Protein: P51608

MECP2, Methyl-CpG-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MECP2P51608 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MECP2P51608 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MECP2P51608 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MECP2P51608 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MECP2P51608 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MECP2P51608 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MECP2P51608 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MECP2P51608 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MECP2P51608 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MECP2P51608 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MECP2P51608 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MECP2P51608 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MECP2P51608 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MECP2P51608 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MECP2P51608 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MECP2P51608 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MECP2P51608 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MECP2P51608 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MECP2P51608 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MECP2P51608 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MECP2P51608 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MECP2P51608 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MECP2P51608 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MECP2P51608 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MECP2P51608 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MECP2P51608 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MECP2P51608 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MECP2P51608 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MECP2P51608 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MECP2P51608 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MECP2P51608 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MECP2P51608 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MECP2P51608 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MECP2P51608 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MECP2P51608 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MECP2P51608 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MECP2P51608 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MECP2P51608 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MECP2P51608 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MECP2P51608 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MECP2P51608 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MECP2P51608 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MECP2P51608 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MECP2P51608 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MECP2P51608 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MECP2P51608 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MECP2P51608 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MECP2P51608 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MECP2P51608 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MECP2P51608 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MECP2P51608 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MECP2P51608 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MECP2P51608 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms