Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC10P48553 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC10P48553 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC10P48553 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC10P48553 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms