Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
REG1BP48304 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG1BP48304 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG1BP48304 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG1BP48304 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG1BP48304 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG1BP48304 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG1BP48304 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
REG1BP48304 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
REG1BP48304 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
REG1BP48304 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
REG1BP48304 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG1BP48304 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG1BP48304 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG1BP48304 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG1BP48304 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG1BP48304 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
REG1BP48304 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
REG1BP48304 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
REG1BP48304 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
REG1BP48304 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
REG1BP48304 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
REG1BP48304 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
REG1BP48304 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
REG1BP48304 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
REG1BP48304 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
REG1BP48304 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
REG1BP48304 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
REG1BP48304 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
REG1BP48304 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
REG1BP48304 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
REG1BP48304 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
REG1BP48304 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG1BP48304 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG1BP48304 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG1BP48304 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG1BP48304 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG1BP48304 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG1BP48304 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
REG1BP48304 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
REG1BP48304 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms