Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
UTRNP46939 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
UTRNP46939 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UTRNP46939 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
UTRNP46939 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UTRNP46939 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UTRNP46939 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UTRNP46939 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
UTRNP46939 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
UTRNP46939 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30■■■□□ 2.39
UTRNP46939 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30■■■□□ 2.39
UTRNP46939 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UTRNP46939 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30■■■□□ 2.39
UTRNP46939 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
UTRNP46939 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UTRNP46939 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
UTRNP46939 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
UTRNP46939 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
UTRNP46939 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UTRNP46939 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UTRNP46939 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UTRNP46939 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UTRNP46939 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UTRNP46939 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UTRNP46939 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
UTRNP46939 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
UTRNP46939 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UTRNP46939 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UTRNP46939 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UTRNP46939 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
UTRNP46939 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
UTRNP46939 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
UTRNP46939 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
UTRNP46939 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UTRNP46939 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
UTRNP46939 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UTRNP46939 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UTRNP46939 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
UTRNP46939 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UTRNP46939 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UTRNP46939 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UTRNP46939 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UTRNP46939 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
UTRNP46939 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UTRNP46939 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
UTRNP46939 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UTRNP46939 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
UTRNP46939 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UTRNP46939 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UTRNP46939 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
UTRNP46939 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UTRNP46939 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UTRNP46939 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UTRNP46939 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
UTRNP46939 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UTRNP46939 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UTRNP46939 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
UTRNP46939 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
UTRNP46939 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UTRNP46939 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UTRNP46939 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
UTRNP46939 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
UTRNP46939 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
UTRNP46939 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
UTRNP46939 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UTRNP46939 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UTRNP46939 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UTRNP46939 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UTRNP46939 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
UTRNP46939 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UTRNP46939 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
UTRNP46939 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UTRNP46939 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UTRNP46939 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UTRNP46939 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
UTRNP46939 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
UTRNP46939 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UTRNP46939 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UTRNP46939 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UTRNP46939 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UTRNP46939 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
UTRNP46939 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
UTRNP46939 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UTRNP46939 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UTRNP46939 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UTRNP46939 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UTRNP46939 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
UTRNP46939 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UTRNP46939 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
UTRNP46939 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
UTRNP46939 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms