Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAGEA4P43358 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAGEA4P43358 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAGEA4P43358 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms