Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
NCAPD3P42695 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
NCAPD3P42695 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
NCAPD3P42695 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC43.2■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
NCAPD3P42695 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
NCAPD3P42695 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
NCAPD3P42695 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms