Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKCIP41743 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKCIP41743 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCIP41743 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms