Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GARSP41250 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GARSP41250 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GARSP41250 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GARSP41250 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GARSP41250 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARSP41250 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARSP41250 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARSP41250 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARSP41250 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARSP41250 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GARSP41250 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARSP41250 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARSP41250 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARSP41250 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARSP41250 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GARSP41250 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARSP41250 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARSP41250 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARSP41250 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARSP41250 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARSP41250 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GARSP41250 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GARSP41250 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GARSP41250 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARSP41250 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARSP41250 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARSP41250 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARSP41250 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARSP41250 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GARSP41250 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARSP41250 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARSP41250 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARSP41250 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GARSP41250 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GARSP41250 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GARSP41250 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GARSP41250 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GARSP41250 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GARSP41250 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GARSP41250 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GARSP41250 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GARSP41250 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GARSP41250 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GARSP41250 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARSP41250 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARSP41250 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARSP41250 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARSP41250 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARSP41250 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARSP41250 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GARSP41250 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GARSP41250 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARSP41250 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARSP41250 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GARSP41250 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARSP41250 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GARSP41250 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARSP41250 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARSP41250 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARSP41250 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARSP41250 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARSP41250 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GARSP41250 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GARSP41250 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARSP41250 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARSP41250 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARSP41250 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GARSP41250 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARSP41250 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARSP41250 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GARSP41250 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms