Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF93P35789 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF93P35789 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF93P35789 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF93P35789 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF93P35789 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF93P35789 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF93P35789 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms