Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC13P31276 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC13P31276 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1570.8 ms