Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD6P30203 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD6P30203 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD6P30203 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD6P30203 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD6P30203 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD6P30203 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD6P30203 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD6P30203 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD6P30203 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD6P30203 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD6P30203 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD6P30203 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD6P30203 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD6P30203 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD6P30203 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD6P30203 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD6P30203 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD6P30203 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD6P30203 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD6P30203 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD6P30203 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD6P30203 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD6P30203 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD6P30203 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD6P30203 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD6P30203 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD6P30203 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD6P30203 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD6P30203 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD6P30203 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD6P30203 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD6P30203 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD6P30203 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD6P30203 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD6P30203 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD6P30203 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD6P30203 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD6P30203 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD6P30203 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD6P30203 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD6P30203 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD6P30203 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD6P30203 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD6P30203 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD6P30203 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD6P30203 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD6P30203 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD6P30203 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD6P30203 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD6P30203 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD6P30203 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD6P30203 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD6P30203 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD6P30203 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD6P30203 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD6P30203 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD6P30203 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms