Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINB3P29508 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINB3P29508 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms