Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GTF2E1P29083 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
GTF2E1P29083 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GTF2E1P29083 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GTF2E1P29083 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms