Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNCP24863 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNCP24863 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNCP24863 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNCP24863 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNCP24863 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNCP24863 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNCP24863 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNCP24863 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNCP24863 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNCP24863 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNCP24863 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNCP24863 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNCP24863 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNCP24863 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNCP24863 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNCP24863 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNCP24863 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNCP24863 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNCP24863 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNCP24863 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNCP24863 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNCP24863 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNCP24863 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNCP24863 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNCP24863 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNCP24863 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNCP24863 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNCP24863 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNCP24863 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNCP24863 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNCP24863 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNCP24863 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNCP24863 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNCP24863 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNCP24863 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNCP24863 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNCP24863 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNCP24863 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNCP24863 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNCP24863 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNCP24863 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNCP24863 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNCP24863 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNCP24863 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNCP24863 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNCP24863 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNCP24863 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNCP24863 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNCP24863 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNCP24863 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNCP24863 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNCP24863 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNCP24863 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNCP24863 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNCP24863 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNCP24863 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNCP24863 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNCP24863 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNCP24863 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNCP24863 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNCP24863 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms