Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCEA1P23193 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCEA1P23193 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TCEA1P23193 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms