Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP8P22894 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP8P22894 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP8P22894 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP8P22894 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP8P22894 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP8P22894 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MMP8P22894 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP8P22894 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP8P22894 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP8P22894 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP8P22894 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP8P22894 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP8P22894 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP8P22894 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP8P22894 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP8P22894 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP8P22894 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP8P22894 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP8P22894 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP8P22894 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP8P22894 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP8P22894 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP8P22894 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP8P22894 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP8P22894 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP8P22894 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP8P22894 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP8P22894 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP8P22894 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP8P22894 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP8P22894 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP8P22894 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP8P22894 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP8P22894 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP8P22894 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP8P22894 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP8P22894 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP8P22894 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP8P22894 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP8P22894 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP8P22894 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP8P22894 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP8P22894 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP8P22894 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP8P22894 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP8P22894 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP8P22894 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP8P22894 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP8P22894 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP8P22894 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP8P22894 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP8P22894 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP8P22894 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP8P22894 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP8P22894 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP8P22894 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP8P22894 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP8P22894 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP8P22894 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP8P22894 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP8P22894 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP8P22894 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms