Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPS1L1P21108 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPS1L1P21108 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1L1P21108 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPS1L1P21108 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPS1L1P21108 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPS1L1P21108 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1L1P21108 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1L1P21108 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1L1P21108 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1L1P21108 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms