Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3P19429 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNNI3P19429 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms