Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXB4P17483 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXB4P17483 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXB4P17483 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.2 ms