Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ITGB4P16144 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ITGB4P16144 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ITGB4P16144 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITGB4P16144 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms