Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-EP13747 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HLA-EP13747 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-EP13747 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms